Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MESP1Q9BRJ9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms