Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCK3Q9BQ16 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms