Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms