Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYCBPQ99417 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYCBPQ99417 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms