Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms