Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HHIPQ96QV1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms