Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC7Q96NW7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC7Q96NW7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC7Q96NW7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC7Q96NW7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC7Q96NW7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC7Q96NW7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC7Q96NW7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC7Q96NW7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC7Q96NW7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms