Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms