Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms