Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms