Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms