Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPD52L3Q96J77 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms