Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00526Q96FQ7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms