Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNPO1Q92973 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms