Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1AQ92747 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1AQ92747 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms