Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRUQ92729 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms