Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms