Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHIPQ8WWQ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHIPQ8WWQ0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHIPQ8WWQ0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHIPQ8WWQ0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PHIPQ8WWQ0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHIPQ8WWQ0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PHIPQ8WWQ0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHIPQ8WWQ0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHIPQ8WWQ0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHIPQ8WWQ0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms