Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1orf54Q8WWF1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms