Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms