Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCOLN3Q8TDD5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCOLN3Q8TDD5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCOLN3Q8TDD5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCOLN3Q8TDD5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCOLN3Q8TDD5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCOLN3Q8TDD5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCOLN3Q8TDD5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCOLN3Q8TDD5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCOLN3Q8TDD5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCOLN3Q8TDD5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCOLN3Q8TDD5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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