Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHZ7

MBD3L2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L2Q8NHZ7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD3L2Q8NHZ7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L2Q8NHZ7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms