Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATL2Q8NHH9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms