Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYRIPQ8NFW9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms