Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms