Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms