Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RNF182Q8N6D2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RNF182Q8N6D2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RNF182Q8N6D2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RNF182Q8N6D2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RNF182Q8N6D2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RNF182Q8N6D2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF182Q8N6D2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RNF182Q8N6D2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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RNF182Q8N6D2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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RNF182Q8N6D2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RNF182Q8N6D2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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