Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG2Q8N3U4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms