Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VWDEQ8N2E2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms