Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00518Q8N0U6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00518Q8N0U6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00518Q8N0U6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00518Q8N0U6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00518Q8N0U6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00518Q8N0U6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00518Q8N0U6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00518Q8N0U6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00518Q8N0U6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00518Q8N0U6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00518Q8N0U6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00518Q8N0U6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms