Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms