Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms