Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAPLN4Q86UW8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms