Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms