Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP50Q70EL3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP50Q70EL3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms