Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms