Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC73Q6ZRK6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms