Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIAT1Q6ZQX7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms