Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM72Q6ZMU5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms