Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTE2Q6XPS3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPTE2Q6XPS3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms