Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
METAP1DQ6UB28 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
METAP1DQ6UB28 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms