Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms