Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms