Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms