Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms