Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms