Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LDLRAD1Q5T700 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms