Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC2Q5JST6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC2Q5JST6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms