Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ESCO2Q56NI9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms