Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms